Programma 

Nel corso si affronteranno i principali step di analisi usati nello studio dei microbiomi. Si partirà con un'introduzione sull'ambito scientifico e un inquadramento pratico dell'ambiente di sviluppo delle pratiche per produrre analisi riproducibili.

Si passerà a tematiche generali quali il trattamento di file raw di sequenziamento HTS i processi di QC e l'identificazione tassonomica.  Nella terza parte del corso verrà dato spazio alle tecniche statistiche in uso comune per l'analisi base dei microbiomi

Day 1

• Breve introduzione sui concetti di Metagenomica. Di cosa parleremo?

• Design sperimentale